Re.Data – Re.data

Áreas prioritárias de interesse e atuação no âmbito da GDI: sondagem

by Re.Data

on 9 de Abril, 20269 de Abril, 2026

A presente sondagem foi enviada à Rede Portuguesa de Data Stewards (RPDS) no dia 03 de março de 2026, tendo sido reforçada com um lembrete a 04 de março de 2026.

O objetivo foi identificar áreas prioritárias de interesse e atuação no âmbito da gestão de dados de investigação.

Caracterização das respostas

Total de respostas recebidas: 80
Respostas excluídas: 4 (por inconsistência ou invalidação)
Total de temas identificados: 81
Nota metodológica: algumas respostas incluíram múltiplos temas, tendo sido desdobradas para melhor análise.

Distribuição dos temas identificados

A análise realizada evidencia que os dois temas mais destacados correspondem às principais preocupações da comunidade: o tratamento de dados sensíveis e os planos de gestão de dados.

Adicionalmente, foram identificados temas de elevada relevância, nomeadamente, a inteligência artificial e o papel dos data stewards, em particular no que diz respeito às suas competências e desenvolvimento profissional.

Num nível intermédio, surgem tópicos como a curadoria de dados, os repositórios e os incentivos, métricas e requisitos de financiadores.

Assim, podemos destacar as seguintes conclusões:

A sensibilidade dos dados assume um papel central, evidenciando preocupações éticas, legais e operacionais.
Existe uma forte preocupação com a estruturação da gestão de dados, particularmente através de planos formais.
Verifica-se um interesse crescente na inteligência artificial e na profissionalização dos data stewards.
Algumas áreas críticas, como a segurança e serviços, poderão estar sub-representadas, sugerindo oportunidades para futura sensibilização.

Priority areas of interest and activity within RDM: survey

This survey was sent to the Portuguese Network of Data Stewards (RPDS) on 3 March 2026 and was followed up with a reminder on 4 March 2026.

The aim was to identify priority areas of interest and activity within the field of research data management.

Overview of responses

Total responses received: 80
Responses excluded: 4 (due to inconsistency or invalidation)
Total topics identified: 81
Methodological note: some responses included multiple topics and were therefore split to allow for more accurate analysis.

Distribution of identified topics

The analysis shows that the two most prominent topics reflect the main concerns of the community: handling sensitive data and data management plans.

In addition, the following highly relevant topics were identified: artificial intelligence and the role of data stewards, particularly with regard to their skills and professional development.

At an intermediate level, topics such as data curation, repositories, and incentives, metrics and funder requirements emerged.

Accordingly, the following conclusions can be drawn:

The sensitivity of data plays a central role, raising ethical, legal and operational concerns.
There is a strong focus on the structuring of data management, particularly through formal plans.
There is a growing interest in artificial intelligence and the professionalisation of data stewards.
Some critical areas, such as security and services, may be underrepresented, suggesting opportunities for raising awareness in the future.

A Rede Portuguesa de Data Stewards (RPDS) do projeto Re.Data promoveu sessão sobre ELNs e reúne comunidade emergente

by Re.Data

on 27 de Março, 202627 de Março, 2026

A Rede Portuguesa de Data Stewards (RPDS) uma iniciativa do projeto Re.Data, promoveu uma sessão dedicada aos cadernos electrónicos de laboratório – Electronic Laboratory Notebooks (ELNs), confirmando o avanço de uma comunidade nacional articulada em torno destes instrumentos digitais de registo de investigação.

Em foco estiveram as iniciativas em curso em Portugal, com a apresentação da comunidade eLabFTW Portugal por Maria Paola Tomasino (CIIMAR, Universidade do Porto), da página de Instâncias de ELN em Portugal, por Pedro Príncipe, e as atividades nacionais em desenvolvimento do Grupo de Trabalho em Formação e Competências para a Gestão de Dados FAIR apresentadas por André Vieira (Universidade do Minho).

A sessão contou com uma perspetiva internacional, na voz da investigadora Samantha Pearman‑Kanza (University of Southampton), com uma apresentação intitulada “One Does Not Simply ‘Adopt’ an ELN”.

A investigadora, com vasta experiência em ELNs, no registo de processos, dados FAIR e tecnologias semânticas, sublinhou o facto da implementação de um ELN ir muito além da aquisição de licenças, pois exige tempo, planeamento e uma forte aposta na adesão e capacitação dos utilizadores . Na sua apresentação, explorou estratégias práticas para envolver as equipas, garantir formação contínua e apoiar o uso quotidiano dos sistemas, de forma a que o ELN se torne uma parte integrante e útil da prática laboratorial .

O contributo de Samantha Pearman‑Kanza sobre a adoção de ELNs é particularmente relevante num momento em que as instituições e equipas nacionais começam a consolidar práticas e a trocar experiências de implementação.

Estas iniciativas, que se irão repetir ao longo deste ano, mostram como o ecossistema português está a estruturar redes, recursos e formação específica para apoiar a adoção sustentada de cadernos electrónicos de laboratório.

Portuguese Data Stewards Network (RPDS)- Session on Electronic Research Notebooks

by Re.Data

on 13 de Março, 202613 de Março, 2026

This session will focus on Electronic Laboratory Notebooks (ELNs), highlighting national initiatives: active working group/ community-building effort in this area and international perspectives on adopting ELNs in research environments.

Agenda

Opening & Welcome – Portuguese Data Stewards Network (RPDS)
Ongoing National Activities on Electronic Laboratory Notebooks
-Working Group on Training and Skills for FAIR Data Management (André Viera – University of Minho);
–eLabFTW Portugal Community (Maria Paola Tomasino – CIIMAR. UP)
International Prospective: “One Does Not Simply ‘Adopt’ an ELN” (Samantha Pearman-Kanza – University of Southampton)
Discussion & Q&A
Closing Remarks

One Does Not Simply ‘Adopt’ an ELN. Abstract :
Implementing Electronic Lab Notebooks (ELNs) is a complex and time‑intensive process that involves far more considerations than simply purchasing licenses. One of the most frequently overlooked components of this process is user adoption. Even the most advanced and well‑configured ELN will fail to deliver value if users are not effectively engaged, trained, and supported throughout the implementation and beyond. This talk will explore key considerations and practical strategies for fostering successful user adoption of ELNs, ensuring that the system becomes an integrated and beneficial part of laboratory practice.

Dr Samantha Pearman-Kanza (University of Southampton) -Short Bio:
Dr. Samantha Pearman-Kanza is a Principal Enterprise Fellow at the University of Southampton, the Principal Investigator for the Careers and Skills for Data-driven Research Network (CaSDaR), , the Pathfinder Lead on Process Recording for the Physical Sciences Data Infrastructure (PSDI) Initiative – www.psdi.ac.uk, and a researcher for the AI in Chemistry Hub (AIChemy – www.aichemy.ac.uk). Samantha sits on the Advisory Boards for the Future Labs Live (Basel) and London Labs Live (UK) Conferences, the Machines Learning Chemistry Project (University of Nottingham), the STEP-UP project (Imperial College London), and the Knowledger Project (University of North Florida), and the UK electronic information Group (UKeiG) STRIX Committee. She is also the Faculty Deputy Chair of the Ethics Committee and sit on the Steering Committee for our brilliant Chemistry and Chemical Engineering Enterprise Solutions. Samantha’s key research areas are ELNs, process recording, FAIR data, data stewardship and research data management, and semantic web technologies.

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Microsoft Teams meeting

Join: https://teams.microsoft.com/meet/35085486526036?p=eBmO29zA3SmQ4Xx03m

Meeting ID: 350 854 865 260 36

Passcode: rf6oU95b

Redes Europeias de Data Stewards refletem Crescimento e Cooperação — Portugal em Destaque

by Re.Data

on 10 de Março, 202613 de Março, 2026

*A notícia está acessível neste endereço: https://datastewards.ie/tg7-newsletter/*

As redes europeias de data stewards estão a consolidar-se como estruturas essenciais para apoiar a gestão de dados de investigação num ecossistema científico cada vez mais orientado para os princípios FAIR e para a Ciência Aberta. Em vários países, estas redes assumem um papel estratégico na capacitação de profissionais, no desenvolvimento de políticas e na criação de infraestruturas de suporte. Entre estas iniciativas, a Rede Portuguesa de Data Stewards tem-se afirmado como um exemplo particularmente dinâmico e em rápido desenvolvimento, recebendo crescente visibilidade em eventos e relatórios internacionais.

🌍 Um movimento europeu em expansão

A criação de redes nacionais de data stewards tem sido impulsionada por iniciativas europeias ligadas à Ciência Aberta, com destaque para projetos como o EOSC Focus e grupos especializados como o Professionalising Data Stewardship Interest Group da Research Data Alliance. Este grupo coordena várias task groups dedicadas a temas fundamentais, incluindo perfis profissionais, carreiras, formação, certificação e redes de conhecimento como a TG7, centrada precisamente em networking e troca de experiências entre data stewards a nível internacional.

Em paralelo, países como a Irlanda têm investido na criação de redes formais, como a Sonraí – Irish Data Stewardship Network, estabelecida com financiamento nacional e cujo objetivo é consolidar competências e desenvolver o ecossistema FAIR de forma sustentável.

Estas iniciativas mostram que a profissionalização da gestão de dados deixou de ser um tema emergente para se tornar uma prioridade estrutural no panorama europeu de investigação.

Portugal assume destaque crescente na área

A Rede Portuguesa de Data Stewards tem vindo a destacar-se pela sua organização, visibilidade e capacidade de mobilização da comunidade nacional. Formalizada no contexto das atividades Re.Data, a rede integra profissionais de diversas instituições e tem ganho relevância através de apresentações em eventos europeus e da produção de documentos estruturantes.

🤝 Cooperação entre redes: o valor da internacionalização

A ligação entre redes nacionais é promovida, entre outros espaços, pela TG7 do grupo da RDA, que atua como ponto de encontro para comunidades internacionais de data stewards.

A partilha de práticas, o desenvolvimento de materiais comuns e o reconhecimento mútuo de competências têm permitido fortalecer a identidade profissional dos data stewards e acelerar a adoção de práticas FAIR.

Nesse contexto, a atuação portuguesa tem sido reconhecida, integrando discussões, contribuindo para relatórios, exemplos abaixo, e acolhendo iniciativas de disseminação que elevam o perfil da rede a nível europeu.

Sharma, C. J. M., Holmstrand, K. F., Rauste, P., Ekman, O., Rebernig-Hedman, C. A., Fogtmann-Schulz, A., Drachen, T. M., Vlachos, E., CALDONI, G., Boavida, C. P., Eerland, A., Brinkman, L., Pasquale, V., Osmenaj, E., Rainer, H., Ritschard, E., & Kiesel, M. (2025). M6.2 New Professional Networks.

Zenodo. https://doi.org/10.5281/zenodo.16535740

Sanchez Solis, B., Galica, N., Pazik-Aybar, A., & Vins, D. (2025). Open Science Guide: RDM & FAIR Training Framework for RPOs.

Zenodo. https://doi.org/10.5281/zenodo.15124383

A Rede Portuguesa Da Data Stewards continua a crescer, contando já com 107 membros em todo o país, e destacou-se em 2025 com a realização de um workshop nacional sobre ELNs, um inquérito nacional aos profissionais de apoio à gestão de dados e a apresentação pública de um perfil emergente de competências para data stewards.

Para 2026, estão previstas cinco sessões temáticas, incluindo um evento pré‑Fórum GDI, sendo que a próxima, em março, será dedicada aos electronic laboratory notebooks.

Re.Data a Conectar Dados e Pessoas e a Potenciar Ciência

by Re.Data

on 10 de Fevereiro, 202627 de Março, 2026

O Workshop Re.Data 2026 promovido pela Rede Nacional para a Gestão de Dados de Investigação, reuniu dezenas de profissionais e decisores para refletir sobre o futuro da gestão de dados de investigação em Portugal, num evento integrado na Love Data Week, sob o mote “Dados FAIR, Inteligência Artificial e Serviços GDI em Portugal”. Este workshop correspondeu também à 4ª Reunião da Assembleia Geral do Consórcio Re.Data, Centros GDI & FCT-FCCN, funcionando como reunião aberta à comunidade. O evento ocorreu em modo presencial, mas teve difusão simultânea, online.

A sessão de abertura contou com as intervenções da Reitoria da Universidade do Minho, na pessoa do vice-Reitor António Salgado, da coordenação do Consórcio Re.Data, representado por Pedro Príncipe e de João Nuno Ferreira, vice-Presidente da FCT, sublinhando a importância estratégica dos dados FAIR, da Ciência Aberta e da criação de infraestruturas sustentáveis para suportar o ecossistema científico nacional.

Em destaque esteve a apresentação de Vyacheslav “Slava” Tykhonov, chefe de Interoperabilidade e Inteligência Artificial na CODATA, coautor do padrão emergente Croissant para Machine Learning, tendo demonstrado o seu potencial nos desafios da gestão de dados FAIR nas infraestruturas de dados de investigação. Evidenciou como dados bem descritos e interoperáveis são a base para uma inteligência artificial mais robusta e responsável.

Houve espaço para discussão e perguntas, moderado por Eloy Rodrigues, Director dos Serviços de Documentação da Universidade do Minho

Os resultados do projeto Re.Data e perspetivas futuras foram apresentados, estimulando uma reflexão conjunta, focando os três pilares deste projeto: políticas, formação e curadoria. Foram destacados os recursos produzidos para toda a comunidade, no âmbito do projeto, disponíveis no Website, na Comunidade Re.Data do repositório Zenodo e no canal YouTube.

A equipa da FCT | FCCN apresentou os novos serviços nacionais: POLEN DataHub, o POLEN Blueprint e o POLEN Sync.

Os Centros de competências GDI apoiados pela FCT, apresentaram alguns dados de impacto nas suas instituições, com políticas aprovadas, criação de repositórios e serviços de dados, oferta formativa robusta, redes internas de data stewards e datasets FAIR publicados, evidenciando uma mudança cultural na forma como os dados são planeados, preservados, partilhados e reutilizados.

No final do evento, houve mais uma vez espaço para discussão dos temas e esclarecimento de perguntas colocadas pela audiência presencial e online, tendo sido moderada por Paula Moura, dos Serviços de Documentação e Bibliotecas da Universidade do Minho.

O Workshop Re.Data 2026 encerrou com uma mensagem clara:

Portugal dispõe, hoje, de condições para estabelecer uma rede participativa e sustentável, capaz de ligar dados e pessoas, consolidar serviços nacionais e posicionar a comunidade científica para tirar partido da inteligência artificial com dados mais abertos, mais bem documentados e verdadeiramente FAIR.

Workshop Re.Data 2026: Dados FAIR, Inteligência Artificial e serviços GDI em Portugal

by Re.Data

on 21 de Janeiro, 202610 de Fevereiro, 2026

A Rede Nacional para a Gestão de Dados de Investigação – Re.Data, promove, um evento internacional onde serão apresentados os resultados do Programa Nacional de Ciência Aberta e Dados Abertos de Investigação (PNCA e DAI), discutidos os desafios da gestão de dados FAIR e o papel da Inteligência Artificial nas infraestruturas de dados de investigação.
Contará com a presença de Simon Hodson (Executive Director da CODATA) e Vyacheslav (Slava) Tykhonov (Head of Interoperability and Artificial Intelligence na CODATA)

Local: Universidade do Minho – Campus de Gualtar, Braga | Instituto de Educação – Auditório Multimedia.

Data: 9 de fevereiro

Horário: 11h00-13h00 | 14h00 – 16h00

Formulário de inscrição: [LINK]

10h30-11h00 | Registo e café boas-vindas

11h00-11h30 | Abertura e introdução [apresentação]

António Salgado, Vice-reitor para Investigação e Política Científica da Universidade do Minho.

Pedro Príncipe, Chefe de Divisão nos Serviços de Documentação e Bibliotecas da Universidade do Minho, Coordenador do Consórcio Re.Data.

João Nuno Ferreira, Vice-Presidente da Fundação para a Ciência e a Tecnologia e Coordenador Geral da Unidade de Computação Científica Nacional da FCT.

11h30-12h30 | Desafios da gestão de dados FAIR e a Inteligência Artificial nas infraestruturas de dados de investigação, utilizando o formato Croissant para Machine Learning, Simon Hodson (Executive Director da CODATA) e Vyacheslav (Slava) Tykhonov (Head of Interoperability and Artificial Intelligence na CODATA) [apresentação]

Moderador: Eloy Rodrigues, Diretor dos Serviços de Documentação e Bibliotecas da Universidade do Minho.

12h30-13h00 | Resultados do projeto Re.Data e perspetivas futuras: políticas, formação e curadoria, Pedro Príncipe (Universidade do Minho), Inês Caramelo (Universidade de Coimbra), Maria Tomasino (CIIMAR-UP) , Daniel Alves e Cátia Carvalho (NOVA FCSH), André Vieira (Universidade do Minho) – Consórcio Re.Data. [apresentação]

13h00-14h00 | Almoço

14h00-14h45 | Novos serviços POLEN para dados de investigação: POLEN Blueprint, POLEN DataHub, POLEN Sync, Filipa Pereira, Pedro Sobral, e Sara Pestana, FCCN – Serviços Digitais da FCT [apresentação]

14h45-15h30 | Centros de competência em Gestão de Dados de Investigação: impacto e resultados

Moderador: Paula Moura, Serviços de Documentação e Bibliotecas da Universidade do Minho.

15h30-16h00| Encerramento

Nota: este workshop corresponde à 4ª Reunião da Assembleia Geral do Consórcio Re.Data, Centros GDI & FCT-FCCN – funcionando como reunião aberta à comunidade.

Re.Data capacita profissionais de apoio à GDI e impulsiona uma nova geração de Data Stewards

by Re.Data

on 12 de Janeiro, 202627 de Fevereiro, 2026

Ao longo de 2025, o consórcio nacional Re.Data impulsionou um ecossistema robusto de formação em gestão e curadoria de dados, para diferentes públicos-alvo, cumprindo o previsto no Roteiro de formação, levantamento de competências e requisitos de aprendizagem e alinhando cada ação com as metas operacionais.

O projeto mobilizou centenas de participantes de vários pontos do país para sessões intensivas de formação, nomeadamente, workshops, bootcamps, webinars. Foi ultrapassada a marca dos 1500 participantes nas séries de webinars. Estes números reforçam o papel do Re.Data como referência nacional na capacitação em Ciência Aberta (CA) e Gestão de Dados de Investigação (GDI).

O programa de especialização profissional para curadores de dados, gestores de repositórios e data stewards destacou-se como um dos eixos centrais, contribuindo para a profissionalização de perfis-chave na infraestrutura nacional de GDI. Neste, enquadram-se as duas edições do Workshop de fundamentos da curadoria de dados – especialização para bibliotecários de dados e profissionais de informação, o Workshop dedicado a questões jurídicas, proteção de dados e licenças e o Bootcamp de formação de Data Stewards, reunindo mais de 130 participantes, selecionados entre cerca de duas centenas de candidaturas.

Na vertente de formação de formadores, o Re.Data organizou o Bootcamp de Formação de Formadores em Ciência Aberta e o Workshop de Instrutores de Data Stewards, capacitando vários profissionais no território nacional, que se propuseram a replicar a oferta formativa recebida nas instituições de ensino superior e centros de investigação.

Entre Coimbra e Bragança, estas iniciativas envolveram mais de 60 participantes, selecionados de um total de 94 inscritos, que passam agora a integrar um núcleo estratégico de formadores alinhado com o desenvolvimento da Rede Portuguesa de Data Stewards, prevista no roteiro como estrutura de suporte continuado à comunidade.

Para investigadores, doutorandos e coordenadores de projeto, o ReData promoveu um plano de workshops sobre utilização de cadernos de laboratório eletrónicos, boas práticas de gestão de dados, publicação de dados FAIR por áreas disciplinares e conhecimentos de integridade e ética na gestão e partilha de dados. Os dados de monitorização apontam para mais de 600 inscrições, com um total de cerca de 450 participantes efetivos nestas ações, evidenciando uma procura crescente por competências em planeamento da gestão de dados, preparação e publicação de dados FAIR e tratamento de dados sensíveis ao longo do ciclo de vida da investigação.

Os ciclos de webinars temáticos foram determinantes para alargar o alcance do Re.Data, contando com cerca de 1800 inscrições, das quais se efetivaram mais de 1500 participações. Destacam-se a série de webinars Love Data Week, as séries sobre novos perfis e competências – Open Access Week e a série que abordou a proteção de dados em projetos de investigação.

Estes números sustentam a próxima fase de implementação: o lançamento de dois MOOCs (massive open online courses) – em dados FAIR e dados sensíveis – na plataforma NAU e o crescimento contínuo do Skills Builder Hub, que irá agregar dezenas de recursos de aprendizagem, casos de uso, tutoriais e ferramentas, para apoiar as boas práticas de GDI.

Este grande número de iniciativas concretizadas, em parceria com o elevado volume de participantes coloca o projeto numa posição privilegiada na capacitação da comunidade em CA e GDI, em Portugal, bem como na preparação de instrutores preparados para replicarem juntos dos seus investigadores e unidades de investigação e desenvolvimento, as melhores práticas de GDI.

Em paralelo com a dinamização da Rede Portuguesa de Data Stewards, na realização de reuniões da Assembleia Geral com os centros de competência financiados pela FCT-FCCN e na organização de InfoSessions sobre a EOSC (European Open Science Cloud) reforça o cumprimento das metas de governança e apoio às redes nacionais, previstos para 2025.

Re.Data disponibiliza serviço helpdesk e base de conhecimento

by Re.Data

on 12 de Janeiro, 202612 de Janeiro, 2026

No âmbito da missão do Re.Data, que visa apoiar as atividades de gestão de dados de investigação (GDI), um dos serviços implementados é o serviço de helpdesk, que complementa os materiais de suporte que têm vindo a ser disponibilizados no âmbito do projeto.

O serviço de helpdesk está acessível em https://redata.pt/helpdesk/ e é composto por três elementos principais:
i) gestão de tickets de suporte, ii) base do conhecimento e iii) chatbot.
Em conjunto, estes 3 elementos, oferecem o acesso rápido a respostas sobre práticas de gestão de dados e a possibilidade de colocar questões e obter resposta por parte de uma equipa de especialistas. Este serviço destina-se a quem desenvolve atividades de gestão de dados de investigação e necessitam de esclarecimento de dúvidas ou orientações sobre as melhores práticas a adotar.

Sistema de Helpdesk Re.Data
Gestão de Tickets de Suporte	Base do Conhecimento	Chatbot
Envio de pedidos por parte dos/as utilizadores/as com resposta de especialistas.	Acesso a documentação de apoio, como por exemplo perguntas frequentes.	Interação com um sistema de Inteligência Artificial (IA) que disponibiliza respostas às questões colocadas, tendo por base os conteúdos da base do conhecimento.

O serviço de gestão de tickets de suporte oferece funções básicas de receção de pedidos por parte dos utilizadores com resposta por parte de especialistas. Os utilizadores poderão colocar as suas questões utilizando o formulário online disponível na plataforma, sendo as interações posteriores realizadas por e-mail.

A base do conhecimento disponibiliza documentação de apoio à comunidade, no formato de perguntas frequentes (FAQs), estando categorizadas em 5 áreas: Aplicação dos princípios dos dados FAIR; Compreensão dos perfis e competências para apoio à GDI; Curadoria de dados; Implementação de políticas e estratégias de Ciência Aberta; Proteção de dados, licenças e questões jurídicas.

O utilizador pode navegar pelas categorias ou realizar uma pesquisa para encontrar as respostas pretendidas. Sempre que não encontrar a resposta pretendida, poderá contactar a equipa de suporte utilizando o sistema de tickets.

O chatbot é um interface conversacional baseado em inteligência artificial, que oferece aos utilizadores a possibilidade de colocarem questões e obterem respostas com base nos conteúdos da base do conhecimento. Esta funcionalidade está incorporada no portal do Re.Data, 24 horas por dia, sempre que seja necessário obter uma resposta rápida, estando acessível no canto inferior direito da página com o ícone.

Os conteúdos do sistema de helpdesk pretendem apoiar os utilizadores nas suas atividades de gestão de dados de investigação, contribuindo para o aprimoramento das melhores práticas na prática de gestão de dados.

Re.Data publica Factsheets de dados FAIR

by Re.Data

on 12 de Janeiro, 202612 de Janeiro, 2026

Na sequência da publicação do Quadro de referência para a implementação dos princípios FAIR na gestão de dados de investigação, o Re.Data publicou um conjunto de quatro Factsheets sobre implementação dos princípios FAIR na GDI. Este conjunto de documentos de referência, dirigido a investigadores e equipas de suporte, pretende sistematizar os principais tópicos abordados no Quadro de Referência e apoiar na adoção e implementação dos princípios de dados FAIR (Localizáveis | Findable, Acessíveis| Accessible, Interoperáveis | Interoperable, Reusable | Reutilizáveis) na gestão e partilha de dados de investigação.

Encontram-se disponíveis as seguintes Factsheets:

Estes documentos reforçam o compromisso deste consórcio em apoiar a comunidade científica na adoção consistente dos princípios FAIR e na promoção de boas práticas de GDI.

Gestão de dados na genómica e transcriptómica de abelhas (Apis mellifera)

by Re.Data

on 5 de Janeiro, 202612 de Janeiro, 2026

Como gerir terabytes de dados genómicos sem perder integridade nem eficiência?

Que papel desempenham os repositórios institucionais na investigação em larga escala?

De que forma os princípios FAIR transformam a investigação em genómica?

Quais são os maiores desafios na coordenação de equipas que produzem e analisam dados massivos?

DESCRIÇÃO

O grupo de investigação desenvolve projetos que envolvem a sequenciação em larga escala do genoma (DNA) e do transcriptoma da abelha. Entre os principais projetos encontram‑se MEDIBEES e Better‑B, que abrangem milhares de indivíduos, e o projeto BEE3Pomics, dedicado ao estudo do transcriptoma. A equipa responsável pela análise de dados é constituída por cinco elementos e trabalha com volumes muito elevados de informação, frequentemente na ordem dos terabytes.

A gestão de dados constitui um desafio central. Os dados brutos fornecidos pelas empresas de sequenciação são armazenados no cluster do IPB (https://cedri.ipb.pt/about/cluster), com mecanismos que garantem duplicação e integridade. Estes dados são organizados em pastas com permissões de leitura para todos os membros da equipa, sem possibilidade de modificação, assegurando que o raw data permanece inalterado.

O processamento e a análise são efetuados em contas individuais, sendo os resultados finais duplicados e organizados em diretórios partilhados. Para fins de publicação, os dados genéticos são depositados em repositórios disciplinares, como o NCBI Sequence Read Archive (SRA). As análises integram igualmente genomas externos disponíveis no SRA. Sempre que adequado, informação adicional é disponibilizada em materiais suplementares.

TRÊS LIÇÕES APRENDIDAS

O planeamento é essencial
A definição de um plano de gestão de dados antes do início do projeto é fundamental para evitar redundâncias, clarificar responsabilidades e garantir eficiência ao longo de todo o ciclo de vida dos dados. O planeamento deve incluir a definição de acessos, a escolha das plataformas tecnológicas, a estrutura de organização da informação e os procedimentos de backup e preservação. Este processo não deve ser encarado apenas como uma exigência das entidades financiadoras, mas como uma prática estruturante para assegurar qualidade, consistência e continuidade no trabalho científico.

Os repositórios institucionais são estratégicos
A utilização de plataformas institucionais, como o dados.ip.pt, revela‑se crucial para uma gestão eficaz e sustentável dos dados de investigação. Estas ferramentas facilitam o controlo de versões, promovem a colaboração entre equipas e permitem a atribuição de identificadores persistentes (DOI), contribuindo para uma maior transparência e organização. Além disso, simplificam a preparação de artigos científicos, a elaboração de relatórios para entidades financiadoras e o cumprimento de requisitos de partilha e preservação.

Os princípios FAIR são indispensáveis
A adoção dos princípios FAIR (Findable, Accessible, Interoperable, Reusable) aumenta significativamente a transparência, a reprodutibilidade e o impacto da investigação. Dados bem documentados, acessíveis e interoperáveis facilitam a sua reutilização por outros investigadores, ampliam o alcance dos resultados e reforçam a credibilidade científica. Integrar estes princípios desde as fases iniciais do projeto permite uma gestão mais robusta e alinhada com as melhores práticas internacionais.

TRÊS DESAFIOS FUTUROS

Integração total da equipa
É fundamental assegurar que todos os membros do grupo utilizam o repositório institucional de forma consistente e integrada. A adoção desigual destas plataformas reduz significativamente a sua utilidade e compromete a eficiência da gestão de dados. A utilização sistemática por toda a equipa promove transparência, evita duplicações e reforça a continuidade do trabalho, sobretudo em projetos de longa duração ou com elevada rotatividade de investigadores.

Planos de gestão de dados robustos
A elaboração de planos de gestão de dados que sejam simultaneamente aceites pelas entidades financiadoras e úteis para a equipa de investigação continua a ser um desafio. Estes planos devem ser suficientemente estruturados para garantir conformidade e qualidade, mas também flexíveis para acompanhar a natureza dinâmica dos projetos. Apesar da sua importância, ainda existe apoio limitado para o desenvolvimento destes documentos, que exigem competências técnicas, tempo e coordenação entre diferentes intervenientes.

Ferramentas para monitorização global
A implementação de sistemas institucionais de acompanhamento — semelhantes a plataformas como o GitLab — é essencial para monitorizar prazos, entregas, DOIs e deliverables, assegurando uma gestão integrada e reduzindo o risco de perda de informação. Embora os repositórios desempenhem um papel central na preservação e partilha de dados, não são suficientes para garantir o acompanhamento operacional dos projetos, especialmente no contexto de iniciativas europeias, que exigem níveis elevados de reporte, rastreabilidade e coordenação.

CINCO QUESTÕES SOBRE GDI

Como define, implementa e avalia as práticas de gestão de dados de investigação?

As práticas de gestão de dados de investigação assentam na definição de regras claras para armazenamento, processamento, análise, preservação e partilha. No domínio da genómica, a integridade dos dados brutos é considerada crítica; por esse motivo, os ficheiros são armazenados em duplicado, preferencialmente em locais físicos distintos, e protegidos contra qualquer tipo de alteração. Os objetivos de cada projeto orientam o dimensionamento do espaço necessário, a seleção das ferramentas e a distribuição de responsabilidades. Encontra‑se em implementação um conjunto de procedimentos que inclui a centralização de todos os ficheiros — desde relatórios de qualidade até resultados finais — na plataforma dados.ipb.pt, permitindo o acompanhamento das tarefas e a reutilização de informação. Adicionalmente, recorre‑se ao GitLab para definição de tarefas, prazos e responsáveis, promovendo transparência e eficiência na organização do trabalho.

Quais os principais benefícios dessas práticas?

A adoção de práticas estruturadas de gestão de dados proporciona benefícios significativos ao processo de investigação. A organização clara dos ficheiros facilita a identificação de análises concluídas e de tarefas pendentes, contribuindo para uma gestão mais eficiente e para um trabalho colaborativo mais integrado e transparente.

A redução de redundâncias constitui outro benefício relevante, uma vez que análises intermédias podem ser reutilizadas em diferentes fases do projeto, poupando tempo e recursos. A verificação por vários membros diminui a probabilidade de erros, aumentando a qualidade e a consistência dos resultados.

A existência de informação organizada acelera igualmente a redação de artigos científicos e de relatórios para entidades financiadoras, tornando estes processos mais eficazes. No conjunto, estas práticas otimizam a utilização dos recursos disponíveis e reforçam a fiabilidade e o impacto da investigação.

Em que medida a gestão de dados de investigação contribui para a otimização do processo de investigação?

A gestão eficiente de dados contribui para eliminar repetições desnecessárias, reduzir o consumo de espaço e tempo e agilizar a produção científica. A partilha de scripts entre equipas ou entre membros da mesma equipa constitui um exemplo prático dessa otimização, ao maximizar o conhecimento coletivo e evitar trabalho redundante.

Para que tal seja possível, é essencial que os scripts estejam devidamente anotados e documentados, permitindo a compreensão dos procedimentos e a sua reutilização por qualquer investigador.

A possibilidade de reutilizar análises intermédias em diferentes etapas do projeto aumenta a eficiência global e reduz o esforço duplicado. Assim, estas práticas otimizam simultaneamente os recursos computacionais e humanos e aceleram o avanço científico.

Que vantagens e condicionantes aponta na partilha de dados de investigação?

A partilha de dados contribui para acelerar o progresso científico e aumentar a transparência. No campo da genómica, os mesmos dados podem ser utilizados para responder a questões diversas, maximizando o retorno do investimento público. A partilha também reforça a visibilidade dos investigadores e potencia oportunidades de colaboração e reconhecimento académico.

Entre as condicionantes mais frequentes encontra‑se a insuficiência de metadados, que dificulta a integração e reutilização dos dados em diferentes contextos. Ainda assim, na área da genética, as práticas de partilha encontram‑se relativamente consolidadas, sendo a deposição de dados em repositórios disciplinares uma exigência comum.

De que forma os diferentes atores envolvidos no processo de investigação estão comprometidos com a gestão de dados de investigação?

O investigador principal é responsável pela elaboração de planos de gestão de dados que ultrapassem o mero cumprimento formal das exigências das entidades financiadoras e que contribuam efetivamente para a organização e eficiência do projeto. É igualmente essencial que todos os membros da equipa sigam as recomendações definidas nesses planos, nomeadamente no que respeita à partilha e organização dos dados em repositórios públicos e institucionais, assegurando transparência e acessibilidade.

As instituições desempenham um papel determinante ao disponibilizar recursos organizacionais e financeiros que facilitem a implementação destas práticas. O investimento em repositórios e ações de formação constitui um contributo relevante e poderá evoluir para incluir apoio direto ao planeamento e à gestão de projetos, promovendo processos mais claros e eficientes.

A inclusão de unidades curriculares dedicadas à gestão de dados, especialmente ao nível do doutoramento, é igualmente considerada uma medida importante para garantir que os futuros investigadores compreendem a relevância destas práticas e as aplicam de forma consistente.